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RNA: links para a hipotese do RNA-World

quinta-feira, agosto 10th, 2017

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Mary Hales Mary Hales – 8/10/17

I am a biologist, and I have studied and observed microbial evolution first-hand. It has been established scientifically that RNA is the FiRST genetic molecule to form on Earth. RNA can store genetic information, serve as an enzyme like proteins, and help create both DNA and proteins. Later, DNA and proteins evolved and replaced this “RNA world” because they are more efficient at their respective functions, although RNA still exists and serves vital roles in biology. https://www.omicsgroup.org/journals/first-genetic-information-replication-in-life-origin-on-earth-2168-9296.1000e104.php?aid=6395https://www.merlot.org/merlot/viewMaterial.htm?id=85283 A 2016 study demonstrated for the first time ever that RNA molecules can form in alkaline hydrothermal chimneys. http://www.astrobio.net/news-exclusive/lifes-building-blocks-form-in-replicated-deep-sea-vents/http://online.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/ast.2014.1280
E uma critica “criacionista” aos links acima:
+Mary Hales Sorry, you are dishonest, the RNA world hypothesis is NOT established scientifically. It is a widely contested hypothesis. The experiments in your links & Matt C ‘s links leave more questions unsolved than anything they have xplored. Most biologists think there must have been something like a cell right from the startdemonstrated. The articles even admit that. Quote “Most biologists think there must have been something like a cell right from the start”..end quote, Is taken directly from the link from Matt C in regards to the same experiments as your link covered. Do ‘activated nucleotides’ commonly exist in the inanimate environment? Even so, no RNA has ever been found in thermal vents in nature, nor has any evidence of their ancient existence & linear evolution into DNA been found. I would like to see a synthesised RNA molecule, self replicate into DNA? & then somehow the DNA program itself to manufacture its own RNA’s, proteins, cellular organelles, transcription & protein synthesis machinery?

Ribozima que Replica e Transcreve Um RNA Existente como Template, Para Entender o “RNA-World”

terça-feira, agosto 23rd, 2016

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Scientists take big step toward recreating primordial ‘RNA world’ of 4 billion years ago

https://www.sciencedaily.com/releases/2016/08/160815185822.htm

Date: August 15, 2016 – Source: Scripps Research Institute

E’ preciso notar e nunca se esquecer que esta ribozima que sintetizaram no laboratorio nao produz RNA, como a noticia parece querer transmitir. Ela precisa de um RNA feito antes, ja pronto. Apenas entao ela pode se ligar a ele, usa-lo como template, para replica-lo e transcrever seu codigo na formacao de outras moleculas vitais, inclusive para fazer o RNA produzir copias de si mesma.

E’ um grande e respeitavel e louvavel passo para as Ciencias e nossa fundamental busca do conhecimento sobre as nossas origens. Porem, o grande problema permanece: Como surgiu, antes dessa ribozima, o primeiro RNA? Teria ele vindo de um outro template ainda invisivel e desconhecido por nos que teria existido a 4 bilhoes de anos atras? E’ o que a formula da Matrix/DNA sugere, e ela se mostra a si mesma como sendo este template.

O presente artigo suscita algumas pesquisas, o que sera’ feito aqui no prosseguimento: 

Pesquisa:

– ribozyme [a special RNA enzyme]

3D structure of a hammerhead ribozyme

                                                       Estrutura tridimensional de uma ribozima

Definicao:

Uma ribozima é uma molécula de RNA com capacidade auto-catalítica semelhante às enzimas. O termo ribozima, em si, deriva da combinação das palavras enzima de ácido ribonucleico. As ribozimas são moléculas de RNA que possuem a capacidade de atuar como catalisadores,ou seja, de diminuir a energia de ativação de uma reação de forma específica. Tal como as enzimas proteicas, possuem um centro activo que se une especificamente a um substrato e que facilita a sua conversão num produto. As ribozimas são menos versáteis que as enzimas protéicas

Questao: O que realmente e’ “catalizar”? Onde existem exemplos na nossa vida real deste tipo de evento? Porque na Natureza e’ necessario “diminuir a energia de ativacao de uma reacao, … de uma forma especifica?”

O que isto significa quando pensamos na formula da Matrix/DNA, apenas no estado de template abstrato, e sendo copiada, manifestada, no mundo material? Bem,… acho que basta pensar num humano-crianca, crescendo no ritmo do ciclo vital. Se ele crescer ( ou nao crescer) em outro ritmo errado, nao vai haver transformacao para adolescente, jovem, e adulto. Entao, a materia bruta do planeta nao tem relogio biologico… ( epa! Eureka?! Foi aqui que comecou este fenomeno de relogio biologico, ciclo circadiano., etc? Ribozimas seriam o ancestral primordial do relogio biologico?), e por nao ter relogio biologico e nenhum outro motivo para controlar reacoes em acordo com algum ritmo metodico, precisava existir as ribozimas que se impoe a essa materia bruta, exigindo, ou tocando, um ritmo e exigindo que os atomos se comportem movendo-se em sintonia com este ritmo. Esta bem… respondida a questao.

Centro Ativo … da riboenzima:

O sítio ativo (ou centro ativo) é a pequena região de uma enzima onde ocorrerá uma reação química. Provém de grupamentos de partes da sequência de aminoácidos. As enzimas são muito específicas para os seus substratos. Esta especificidade se deve à existência, na superfície da enzima de um local denominado sítio de ligação do substrato. O sítio de ligação do substrato de uma enzima é um arranjo tridimensional de aminoácidos de uma determinada região da molécula, geralmente complementar à molécula do substrato, e ideal espacial e eletricamente para a ligação do mesmo . O sítio de ligação do substrato é capaz de reconhecer inclusive isômeros óticos “D” e “L” de um mesmo composto. Este sítio pode conter um segundo sítio, chamado sítio catalítico ou sítio ativo, ou estar próximo dele; é neste sítio ativo que ocorre a reação enzimática.

Buscar outros termos no artigo para pesquisa e Googlar “riboenzyme” e continuar pesquisa.